位于东京西部的巨大的“学园都市”，这座总人口达230万的城市中，学生比例约占八成。为了开发学生的超能力，这里实施着特殊的课程体系能力，从“无能力（Level 0）”到“超能力（Level 5）”，共分为六个等级进行评定。这是一所拥有远超世间常识的科学技术，让每个人都能获得科学能力、安全生活的梦幻般教育机构——在这份和平的表象之下，存在着名为“暗部”的组织，他们专门接手那些永远无法见光的“脏活”。
“道具（Item）”是由四名少女组成的精锐部队：能够自由操控氮气，构筑铁壁防御的绢旗最爱；善用爆炸物与陷阱，将战场玩弄于股掌之间的芙兰达·塞维伦；能够读取并追踪能力者所释放的微弱力量的泷壶理后；在学园都市中仅有的七位“超能力者（Level 5）”之一的麦野沉利。出现在她们面前的第五位少女，这份相遇将“道具”引向了新的黑暗深渊……
这是一个描绘暴力、不义与背德交织，一群相当特立独行的超能力少女们的日常、羁绊，以及那深邃无边的“黑暗”的故事。